治療時疼痛的輕重,依每個人忍受疼痛程度而有所不同，治療部位及磨皮區域的大小也是一重要因素。通常二氧化碳雷射磨皮較鉺雅克疼痛。 雷射治療時不需要全身麻醉，大部分人都採取局部麻醉貼片(如EMLA)，少數人會給予局部麻醉注射，醫師也會視情況決定合適的麻醉方式。
雷射磨皮後會有開放性傷口，為防止發炎感染，醫師通常會使用各種敷料，以提供濕潤環境、促進表皮組織增生，使傷口早日癒合。敷料的種類繁多，有膠狀、乳膏、凝膠，保持傷口的清潔、固定是要點，通常需要使用7-10天。
雷射術後的色素沉澱，是東方人種最常見的的副作用。病人在接受手術後應避免日曬數個月，也必須配合醫師處方擦去斑藥膏及防曬乳液，來防止色素沉著的發生。如果出現色素沈著，通常只是暫時性的現象，經過二至三個月左右就會逐漸淡化。在恢復期間，可以使用一些遮瑕膏、防曬乳液掩飾。 色素問題的發生，與治療深度、雷射機型、病患體質都有關係，一旦產生常常造成醫療問題。這也讓醫師的治療態度日趨保守，只願意做淺層處理，但也造成病患術後的滿意程度偏低，覺得磨皮沒有效果。
口唇、眼框皮膚較薄部位，本身有血管擴張、酒糟體質，容易在雷射磨皮部位，產生容易潮紅、血管增生、持久不退的紅斑。
傷口護原期的敷料選擇，可以防止紅斑產生。染料雷射也可以用來處理血管問題。
感染、疤痕，是雷射磨皮最嚴重的併發症，術前的仔細評估，術後的追蹤照顧，可以減少併發症的出現。
雷射磨皮的過程大公開
麻醉：
磨皮進行：
更換敷料：
人工皮(2nd Skin)：親水性的膠膜，可提供充分滋潤，吸附滲出液、分泌物，通常使用在磨皮後2-3天
癒合敷料DuoDERM：常用在傷口癒合後期，類似膚色、更換方便，也有防水作用。像是貼了撒隆巴斯。
